Люминесцентный суп

[nervo4ka]

    Недавно шефу вздумалось сделать красивых фотографий люминесцентного собрата нашего холерного вибриона (Vibrio cholerae) - Vibrio harveyi. Только он меня забыл об этом предупредить. Сказал: "Захвати камеру, пофотографируем светящиеся тарелки", а оказалось, что он хотел запечатлеть светящуюся от бактерий колбу. А я вообще не знаю, как в кромешной темноте снимать, поэтому сделала несколько фотографий на 30 секундной выдержке, не вдохновилась и послала его нафиг. У меня эксперимент горел, мне некогда было разбираться, как из говняшков делаются конфетки. Если кто знает, то расскажите, а то я так и поняла, как в темноте фокусироваться. ;)) 

    Решила показать вам одну из фотографий, а то когда вы еще увидите светящихся бактерий. ;)) Сейчас расскажу механизм, который, как все уже знают из моих редких научных постов, называется Quorum Sensing, или, как я нашла в русском переводе, «ощущение кворума».


«Кворум сенсингом» называют способность бактерий чувствовать плотность популяции и использовать эту информацию в регуляции активности генов. То есть, когда концентрация бактерий в среде низкая, то активна одна группа генов, ответственных за производство определенных белков. А когда концентрация бактериальных клеток достигает порогового уровня, то первая группа генов, грубо говоря, отключается, и включается другая, которая производит другие белки. Медиатором этого процесса служат небольшие сигнальные молекулы вроде гормонов у человека. Когда с увеличением плотности популяции увеличивается концентрация сигнальных молекул, они связываются с рецепторами на поверхности клетки и запускают каскад реакций, который приводит к активации одних генов и выключению других.

Одним из процессов, который регулируется кворум сенсингом, является биолюминесценция. Проще говоря, бактериальная культура начинает светиться, и это свечение вы и видите на фотографии. Если колбу потрясти, то она становится еще ярче. А если культуру разбавить раз в 1000, то свечение исчезнет до тех пор, пока плотность бактериальной популяции снова не достигнет порогового уровня. Этот фенотип (свечение) - очень удобное средство для изучения роли тех или иных генов в регуляции кворум сенсинга.

Надеюсь, что объяснила понятно, а то я не знаю, как о своей науке по-русски говорить. ;))

Comments

[sinych.livejournal.com]

Штатив, ручная выдержка, прикрытая диафрагма (по желанию), низкое ИСО, ручной фокус (можно автомат, если у камеры подсветка фокуса включается, только никакого Vibration Reduction)...

[nervo4ka.livejournal.com]

Где-то так и было, только ничего не вышло. Надо еще поэкспериментировать, а то стыдно не знать.

[simply-mom1966.livejournal.com]

интересно, но непонятно:-)

[nervo4ka.livejournal.com]

Потому что я плохой объясняльщик. =((
Наверное, нужно было еще проще.

[simply-mom1966.livejournal.com]

нет, это просто я в бактериях ничего не смыслю!
но я поняла, что им в куче- нравится:-)

[hejjhog.livejournal.com]

Подожди, биолюминесценция - это, получается из твоих слов, естественная реакция на повышенную плотность популяции у бактерий, или вы что-то под промотор поставили?
И если естественная - какие бактерии это умеют, и зачем им это???

[nervo4ka.livejournal.com]

Биолюминесценция - это естественная реакция, которая встречается у Vibrio harveyi и V. fischeri. Зачем она нужна первой бактерии, я не в курсе, а у Vf это целый симбиотический механизм проживания на кальмаре. Вот кусочек статьи, чтобы понятно было:
The luminous bacterium Vibrio fischeri lives in a cooperative association with the Hawaiian bobtail squid, Euprymna scolopes. The squid has developed a specialized light-emitting organ to house the bacteria within the animal's mantle cavity. When juvenile E. scolopes squid hatch, they are symbiont free and must acquire V. fischeri from the surrounding seawater. The bacteria enter the nascent organ through six pores which connect to ducts that, in turn, lead to specialized, epithelium-lined crypts. Once inside these crypts, the bacteria divide rapidly and fill the light organ with approximately 5 × 10 5 cells. During this colonization process, after a critical cell density is reached, the bacteria induce the lux operon and begin to luminesce. The animal can control the amount of light emitted to the environment and uses this luminescence during its nocturnal activities, probably as a means to disguise itself from predators. At dawn, the host expels approximately 95% of the bacteria; the remaining symbionts multiply over the next 12 h, thereby providing the squid again with a source of luminescence by nightfall.

Наш холерный вибрион не светится, но мы делаем transcriptional fusions c lux operon'ом, который у нас встроен в плазмиду. Надеюсь, ты поняла, что я сказала, потому что сама я как-то не очень умею выражаться научным языком. =))

[reimei.livejournal.com]

я вечно хочу сфоткать свои гламурные розовые и желтые Еколи, которые я выращиваю на минипреп ))

[nervo4ka.livejournal.com]

Давай! Будет интересно посмотреть.

[dreamvoyage.livejournal.com]

Что-то непонятное... и похожее на НЛО. -)

[nervo4ka.livejournal.com]

Зато красиво. 8)

[simplefoto.livejournal.com]

С мыльницой -- никак) С зеркалкой, если в видоискатель ничего не видно, есть способ (секретный, учти). Ставишь камеру на штатив, и, при включенном свете, фокусируешься на ту точку, где будет стоять объект. Вручную или на автомате, неважно, не забудь автомат отключить). Далее все просто, приоритет диафрагмы с экспозамером по самому светящемуся объекту. Диафрагма должна быть максимально открыта, снимать или пультом, или с задержкой пуска (все-таки камера от срабатывания шторок трясется меньше, чем от пальца). Вот и все, удачи)
P.S. можно еще фокусироваться в полной темноте на глазок. Объект должен быть не ближе, чем твой десятикратный фокус и не дальше, чем 20-кратный (то есть на фокусе 20 мм -- от 20-ти до 40-ка сантиметров). В ручном режиме фокусировки выворачиваешь кольцо фокусировки до упора по часовой стрелке, а потом против часовой чуть меньше, чем на одну четверть хода. А далее задача сводится к предыдущей)

[nervo4ka.livejournal.com]

Спасибо! Что-то мне мозгов не хватило сначала сфокусироваться при свете. =)

[marie-mari.livejournal.com]

круто, прям не могу. у меня тоже колбы иногда светятся, но просто потому что соединения лантанидов сильно люминесцентные. но вот так, чтоб туда-сюда, это вообще атас

[nervo4ka.livejournal.com]

Это потому, что бактерии живые! ;))

[rattrasher.livejournal.com]

помощь вспышкой для автофокуса есть? включай.
Если нет, ставь все на штатив и стол, фокусируй вручную при свете. потом выключай свет и фоткай. Фоткать на автоспуске. Исо - маленькое, выдержка - конская. может быть и минута, и две - зависит от флуюресценции. Колбы не трогать, пол не трясти на фотоаппарат - не дуть. Можешь взять фонарик и эту минуту, пока идет выдержка, побегать с влкюченным фонариком на заднем плане. Будет красиво :-)

[nervo4ka.livejournal.com]

Спасибо! Где-то так и делала, но что-то мне мозгов не хватило сначала сфокусироваться при свете. =)

[shuntik.livejournal.com]

интересная информация. про фотографирование - штатив обязательно, задержка тоже

[nervo4ka.livejournal.com]

Штатив был. А слово "задержка" навевает другие мысли. ;))

[la-luminella.livejournal.com]

Вау. Вау, как интересно. Это зеленое свечение напомнило мне историю из детства. Мы - островитяне очень часто баловались приготовлением икры-пятиминутки, с солью, так вот однажды вырубили свет, кто-то пошел на кухню, а в холодильнике банка с икрой светится примерно так же, только более голубоватый свет, очень яркий. Что там была за культура и откуда и почему такого цвета до сих пор загадка, а икру выкинули :-((