![[personal profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/user.png){kind=small}
Xylella fastidiosa, или чем я теперь занимаюсь
Расскажу что ли, чем я теперь буду заниматься как я это не понимаю после трех недель погружения в новую научную область. Моя новая лаборатория, точнее часть ее, занимается изучением виноградного патогена Xylella fastidiosa. В Калифорнии эта бактерия поражает виноград, миндаль, люцерну, олеандр, а в Бразилии цитрусовые. Само собой, в виноградном штате изучать эту заразу особенно актуально, а сама болезнь называется Pierce's disease (PD).
Сама бактерия ничем особо не примечательная. Грам-негативная палочка, которая живет в ксилеме винограда. (Почесала затылок, вспоминая, что такое ксилема. Я ботанику последний раз изучала на первом курсе универа, то есть сто лет назад 8))). Ксилема - это один из видов проводящей ткани в растениях, по которой идет транспорт воды от корней к листьям, если я не вру. ;))
Так вот, а заражение виноградных кустов происходит с помощью насекомого, которое называется glassy-winged sharpshooter. Это какой-то вид цикадок, который я не знаю, как называется по-русски,поэтому зову его долбоносиком. Эти насекомые, которые питаются соком растений, переносят бактерии на своем ротовом аппарате, и когда присаживаются пожрать, бактерии проникают в стебли и листья растений и начинают там в ксилеме размножаться, закупоривая проводящие сосуды.
Выглядит это как-то так.
То есть нарушается транспорт воды по тканям, и листья винограда начинают сначала сохнуть по краям, выглядя опаленными (scorching), а потом опадают. Из-за этого снижается урожайность пораженных виноградников. То есть, к самим ягодам эта болезнь не имеет никакого отношения, их можно есть и не бояться. ;))
Было показано, что Xylella fastidiosa, как и моя любимая бактерия Vibrio cholerae, с которой я работала до этого, тоже может регулирость экспрессию генов с помощью quorum sensing'а (QS), который я и изучала в Вибрио. Вот пост, где я пыталась рассказать, что такое QS. В новой бактерии, конечно же, все совсем по-другому и сложнее, она же патоген растений, а не человека, но тем не менее в этих двух системах есть какое-то сходство.
До меня в новой лабе было показано, что если концентрация бактерий в ксилеме достигает порогового уровня, и, следовательно, концентрация выделяемых ими сигнальных молекул тоже повышается, то бактерии теряют подвижность и не распространяются далеко из очага поражения в новые сосуды. То есть болезнь "замирает". Известен ген, который в бактерии отвечает за производство сигнальных молекул. Этот ген встроили в геном винограда и - та-да! - генно-модифицированные растения стали менее восприимчивы к болезни, которую вызывает Xylella fastidiosa. Тут встает вопрос, не забояццо ли люди факту такой генной модификации, повлияет ли эта мутация на качество винограда и урожайность и далее по списку. Все это в ближайшем времени будет тестироваться и изучаться. А моя миссия (пока) изучать сигнальные молекулы, которые производит бактерия, чтобы понять, какой сигнал сильнее и важнее. Это если совсем просто, а сложно я пока сама не знаю. ;)) Помимо этого, есть еще куча других проектов, которые упадут мне на голову, но я пока не очень их понимаю, чтобы говорить об этом, а тем более доступным языком. Там слишком забористая молекулярная биология.
Новая лаборатория в плане науки довольно сильно отличается от моей аспирантской. Многие эксперименты и теории параллельно тестируются и на растениях, поэтому у нашей лабы есть место в оранжерее, где выращивают экпериментальный виноград (используется сорт cabernet sauvignon ;))), на котором ставят опыты. Например, заражают разными мутантами бактерии и смотрят, как они влияют на развитие болезни Пирса. В какие-то эксперименты вовлекают идолбоносиков цикадок. То есть часть моей работы будет проходить и в оранжерее, но меня пока в эту степь еще не вовлекли. Как правило, этот экспериментальный виноград до урожая не доживает. После заражения бактериями уже через 6-8-12 недель становится виден (или не виден) эффект от заражения, и после этого кусты больше не нужны. Это информация для тех, кому перепал виноград с нашего лабораторного поля, и кто боится его есть. ;)) Но про лабораторное поле в следующий раз, это совсем другая история. ;))
Вот такая теперь у меня наука. 8))
*
Сама бактерия ничем особо не примечательная. Грам-негативная палочка, которая живет в ксилеме винограда. (Почесала затылок, вспоминая, что такое ксилема. Я ботанику последний раз изучала на первом курсе универа, то есть сто лет назад 8))). Ксилема - это один из видов проводящей ткани в растениях, по которой идет транспорт воды от корней к листьям, если я не вру. ;))
Так вот, а заражение виноградных кустов происходит с помощью насекомого, которое называется glassy-winged sharpshooter. Это какой-то вид цикадок, который я не знаю, как называется по-русски,
Выглядит это как-то так.
То есть нарушается транспорт воды по тканям, и листья винограда начинают сначала сохнуть по краям, выглядя опаленными (scorching), а потом опадают. Из-за этого снижается урожайность пораженных виноградников. То есть, к самим ягодам эта болезнь не имеет никакого отношения, их можно есть и не бояться. ;))
Было показано, что Xylella fastidiosa, как и моя любимая бактерия Vibrio cholerae, с которой я работала до этого, тоже может регулирость экспрессию генов с помощью quorum sensing'а (QS), который я и изучала в Вибрио. Вот пост, где я пыталась рассказать, что такое QS. В новой бактерии, конечно же, все совсем по-другому и сложнее, она же патоген растений, а не человека, но тем не менее в этих двух системах есть какое-то сходство.
До меня в новой лабе было показано, что если концентрация бактерий в ксилеме достигает порогового уровня, и, следовательно, концентрация выделяемых ими сигнальных молекул тоже повышается, то бактерии теряют подвижность и не распространяются далеко из очага поражения в новые сосуды. То есть болезнь "замирает". Известен ген, который в бактерии отвечает за производство сигнальных молекул. Этот ген встроили в геном винограда и - та-да! - генно-модифицированные растения стали менее восприимчивы к болезни, которую вызывает Xylella fastidiosa. Тут встает вопрос, не забояццо ли люди факту такой генной модификации, повлияет ли эта мутация на качество винограда и урожайность и далее по списку. Все это в ближайшем времени будет тестироваться и изучаться. А моя миссия (пока) изучать сигнальные молекулы, которые производит бактерия, чтобы понять, какой сигнал сильнее и важнее. Это если совсем просто, а сложно я пока сама не знаю. ;)) Помимо этого, есть еще куча других проектов, которые упадут мне на голову, но я пока не очень их понимаю, чтобы говорить об этом, а тем более доступным языком. Там слишком забористая молекулярная биология.
Новая лаборатория в плане науки довольно сильно отличается от моей аспирантской. Многие эксперименты и теории параллельно тестируются и на растениях, поэтому у нашей лабы есть место в оранжерее, где выращивают экпериментальный виноград (используется сорт cabernet sauvignon ;))), на котором ставят опыты. Например, заражают разными мутантами бактерии и смотрят, как они влияют на развитие болезни Пирса. В какие-то эксперименты вовлекают и
Вот такая теперь у меня наука. 8))
*
no subject
совершенно параллельный мир! =) Но, мне кажется, это уже понятнее, чем светящиеся колбочки!!!
no subject
no subject
сегодня думала на пробежке про твою бактерию: если не знаешь, что бактерия должна делать, тестируй, чего она НЕ должна делать =) Ну там, прыгать и плясать не должна, разговаривать не должна человеческим голосом, например =)
no subject
no subject
no subject
Как оцениваться? А фиг его знает. Мики сказал, что в первый год шеф ничего не ожидает, потому что знает, что бактерия сложная. Там простейшая трансформация может занять минимум месяц, пока ты увидишь (или не увидишь) колонии!
no subject
твоя аккуратность будет как нельзя к месту
no subject
А подводные камни есть везде. На то она и наука, чтобы постоянно преодолевать проблемы, ахаха.
no subject
Ну и присоединяюсь к высказавшимся, что можно ждать хорошего от бактерии с таким названием:-))
no subject
no subject
no subject
Я в прошлом учебном году в числе прочего смотрела видео как раз про QS, теперь буду думать а вдруг я тебя просмотрела. :)
no subject
Ты небось про Bonnie Bassler смотрела.
no subject
no subject
А цикаду я так и не поняла, как перевести. Снайпер что ли? =)))
no subject
no subject
Главное, чтобы эксперименты получались, тогда на работу ходить радостно.
no subject
глаза боятся, а рты едят ;) Спасибо еще раз!
Я думаю, что если я заикнусь еще и о генно-модифицированном винограде, то вряд ли сделаю лучше )))) Или про светящиеся толпы бактерий что-н сморожу. Так что рабочая версия остается: "нет, на этот виноград Лена бактерий не сажала".
no subject
Мне теперь самой интересно на наш огород сходить. Чего они там еще выращивают? И зачем, главное. ;)) Не было у них в детстве принудиловки в виде обязательных сельхоз работ на все лето и осень.
no subject
Мне почему-то кажется, что ты очень скоро увлечешься:-))
no subject
no subject
no subject
no subject
no subject
no subject
no subject
о
меня бы Коля заприкалывал на тему "моя жена веселый фермер", наверно)
но это все глупости, а рисерч, наверно, полезный.
правда, я ваще ничего не понимаю в растениях и их ксилемах-фигемах, у меня нет настолько биологического образования...
надеюсь, что не придется работать с растениями (они для меня как инопланетные формы жизни какие-то, непонятные)
Re: о
no subject
no subject
no subject
no subject
no subject
no subject
no subject
no subject
no subject
no subject
А Францию пока виноградный бог миловал ?
no subject
no subject