Занимательная микроскопия: зубной налет
Jun. 27th, 2018 12:19 pm*
В нашем университете существует специальная летняя программа для "студентов из глубинки", которые только что поступили в университет и с осени начнут полноценно учиться. Для того, чтобы они не впали в шок от количества научной информации и исследовательских возможностей, которых во многих школах США просто нет (как сравнение: школа в деревне Гадюкино с населением 20 тыс человек и гимназия в Москве. Выпускники из этих школ в универе окажутся на разных стартовых позициях), для них проводят вводный трехнедельный курс, читают лекции и показывают лаборатории. Центр микроскопии тоже в списке, поэтому нам нужно показать что-то интересное, но при этом не запредельное для понимания.
Обычно в качестве эксперимента делают простенький соскоб слизистой рта и смотрят на получившиеся эпителиальные клетки разными методами. Я об этом рассказывала в прошлый раз. А я решила немного разнообразить этот метод и заодно показать, что во рту обитает миллионы бактерий разных форм и видов. Микробиолог я или где? 8)) Так что сегодня буду рассказывать о зубном налете и показывать тусовку бактерий из своего рта. Надо сказать, что в процессе сбора информации узнала много нового при том, что мой диссер был немного созвучен с этой темой.

Типы бактерий
Прежде, чем я начну рассказывать о зубном налете, который на 70% состоит из бактерий, хочется немного напомнить школьный учебник по биологии за 5 класс и рассказать, что бактерии можно разделить на группы.
Во-первых, по форме:
- круглые (кокки). Если они образуют цепочку из двух клеток - диплококки. Если цепочка длинная - стрептококки. Если клетки в виде кластера - стафилококки. И тд.
- палочки (бациллы). Сюда можно отнести и возбудителя сибирской язвы и дружелюбные полезные лактобактерии.
- прочие формы (спиральные, завитые). Сюда относится мой любимый холерный вибрион (V. cholerae), который я изучала на PhD, и прочие болезнетворные (и безобидные тоже) бактерии типа трепонемы (вызывает сифилис) или H. pylori (провоцирует гастрит).

Во-вторых, по строению и биохимическим свойствам клеточной стенки:
Клеточная стенка - оболочка клетки, расположенная снаружи от цитоплазматической мембраны и выполняющая структурные, защитные и транспортные функции. В 19 веке был разработан Метод Грама (фамилия такая, никакого отношения к измерению массы 8)), который позволяет окрашивать клеточную стенку бактерий в разные цвета.
- Грам-положительные бактерии (большинство кокков) приобретают темно-синий цвет.
- Грам-отрицательные (например, всем известная палочка E. coli) окрашиваются в красный или розовый цвет.
На картинке показано строение клеточной стенки у Грам (+) и Грам (-) бактерий. В случае первых слой пептидогликанов толстый и образует плотную оболочку, которая и окрашивается в синий цвет. У Грам (-) бактерий слой пептидогликанов тонкий.

Зубной налет и этапы его формирования
Зубной налет - это биофильм (по-русски "биопленка"), в состав которого входит более 1000 видов бактерий, а так же вырабатываемые ими продукты жизнедеятельности. Устойчивая структура зубного налёта обеспечивается липким матриксом, который защищает входящие в его состав бактерии от действия неблагоприятных факторов окружающей среды. То есть это особая форма сосуществования бактерий разных видов на поверхности зуба (и не только, но мы сегодня говорим о зубах), которая приносит его обитателям ощутимую выгоду для выживания и добывания питательных веществ.
Схематическое формирование биофильма выглядит так. Отдельные клетки бактерий прикрепляются к поверхности и начинают вырабатывать липкую "слизь" - экзополисахариды (ЭПС) и гликопротеины, которые помогают бактериям хорошо закрепиться и привлечь других бактерий, которые не могут сами инициировать приклепление. Дружной кучей они начинают быстро размножаться и увеличиваться в размерах образуя структуру, которая по форме напоминает гриб на ножке. В какой-то момент наступает стабилизация, и отдельные бактерии покидают построенный "домик", чтобы найти себе другую поверхность для жизни. Как правило, это происходит в случае, когда не хватает питательных веществ. **На самом деле все гораздо сложнее, и я бью себя по рукам, чтобы не углубиться в молекулярные механизмы, quorum sensing, борьбу за ресурсы, комменсализм и прочие детали, для понимания которых придется написать целый трактат**.

А это налет на зубах (биофильм) в схематичном изображении. Выглядит как поляна с грибами, состоящая из огромного разнообразия бактерий.

Формирование зубного налета происходит в определенной последовательности и включает в себя несколько стадий.
1) После чистки зубов уже через 2-4 часа поверхность зуба заселяют "ранние колонизаторы". Это непатогенные Грам (+) кокки. Затем к ним присоединятся разные палочки, и все вместе они образут первичную пленку на зубах, которую еще не видно. Бактерии получаются нутриенты из слюны и еды, которая попадает в рот.
2) Следом за ними появляются бактерии-мостики - длинные палочки и филаменты, которые помогают менее "липким" бактериям зацепиться за строящийся биофильм.
3) Если плохо следить за гигиеной рта и зубов, то уже через 4-7 дней биофильм разрастается, утолщается и становится привлекательным местом для жизни патогенных бактерий, что влечет за собой воспаление тканей десен.

А что сахар, чем он вреден? Сахар используется бактериями как источник еды и энергии, а в процессе метаболизма выделяется кислота. Она и становится причиной разрушений эмали и деминерализации зубов. Ткань зуба под эмалью - это тоже отличный источник еды для бактерий, поэтому они начинают разрастаться и продолжать свое пакостливое дело. Чем больше на зубах налета, тем бОльший процент патогенных бактерий способных разрушать зубы, там находится. Так что гигиена полости рта (чистка, флосс, регулярный осмотр у дантиста) и твердая пища, которая естественным образом очищает зубы, наше все!
КАРТИНКИ
- К сожалению, у меня не было реагентов для окраски бактерий по Граму, поэтому я использовала другой универсальный краситель. Он окрашивает полисахариды в фиолетовый цвет, а их достаточно в любой бактерии или клетке. Без красителя бактерии под микроскопом увидеть практически невозможно, поэтому пришлось красить.
- Использовала 3 метода микроскопирования: Bright Field, Phase-contrast, DIC.
- Объектив 100х, увеличение в 1000 раз.
****
Bright Field: хорошо различимы круглые бактерии кокки и палочки разной длины, в том числе огромные филаменты.

Видно, что палочки образуют цепочки из нескольких клеток.


Phase-contrast: для бактерий это не самый информативный метод.

DIC: А тут уже интересно, потому что бактерии приобрели 3D объем.


А тут мне за одно попалась та самая эпителиальная клетка полости рта, про которую я рассказывала в прошлый раз. Краситель отлично выделил ее ядро.
Bright Field

Phase-contast

DIC

*
В нашем университете существует специальная летняя программа для "студентов из глубинки", которые только что поступили в университет и с осени начнут полноценно учиться. Для того, чтобы они не впали в шок от количества научной информации и исследовательских возможностей, которых во многих школах США просто нет (как сравнение: школа в деревне Гадюкино с населением 20 тыс человек и гимназия в Москве. Выпускники из этих школ в универе окажутся на разных стартовых позициях), для них проводят вводный трехнедельный курс, читают лекции и показывают лаборатории. Центр микроскопии тоже в списке, поэтому нам нужно показать что-то интересное, но при этом не запредельное для понимания.
Обычно в качестве эксперимента делают простенький соскоб слизистой рта и смотрят на получившиеся эпителиальные клетки разными методами. Я об этом рассказывала в прошлый раз. А я решила немного разнообразить этот метод и заодно показать, что во рту обитает миллионы бактерий разных форм и видов. Микробиолог я или где? 8)) Так что сегодня буду рассказывать о зубном налете и показывать тусовку бактерий из своего рта. Надо сказать, что в процессе сбора информации узнала много нового при том, что мой диссер был немного созвучен с этой темой.

Типы бактерий
Прежде, чем я начну рассказывать о зубном налете, который на 70% состоит из бактерий, хочется немного напомнить школьный учебник по биологии за 5 класс и рассказать, что бактерии можно разделить на группы.
Во-первых, по форме:
- круглые (кокки). Если они образуют цепочку из двух клеток - диплококки. Если цепочка длинная - стрептококки. Если клетки в виде кластера - стафилококки. И тд.
- палочки (бациллы). Сюда можно отнести и возбудителя сибирской язвы и дружелюбные полезные лактобактерии.
- прочие формы (спиральные, завитые). Сюда относится мой любимый холерный вибрион (V. cholerae), который я изучала на PhD, и прочие болезнетворные (и безобидные тоже) бактерии типа трепонемы (вызывает сифилис) или H. pylori (провоцирует гастрит).

Во-вторых, по строению и биохимическим свойствам клеточной стенки:
Клеточная стенка - оболочка клетки, расположенная снаружи от цитоплазматической мембраны и выполняющая структурные, защитные и транспортные функции. В 19 веке был разработан Метод Грама (фамилия такая, никакого отношения к измерению массы 8)), который позволяет окрашивать клеточную стенку бактерий в разные цвета.
- Грам-положительные бактерии (большинство кокков) приобретают темно-синий цвет.
- Грам-отрицательные (например, всем известная палочка E. coli) окрашиваются в красный или розовый цвет.
На картинке показано строение клеточной стенки у Грам (+) и Грам (-) бактерий. В случае первых слой пептидогликанов толстый и образует плотную оболочку, которая и окрашивается в синий цвет. У Грам (-) бактерий слой пептидогликанов тонкий.

Зубной налет и этапы его формирования
Зубной налет - это биофильм (по-русски "биопленка"), в состав которого входит более 1000 видов бактерий, а так же вырабатываемые ими продукты жизнедеятельности. Устойчивая структура зубного налёта обеспечивается липким матриксом, который защищает входящие в его состав бактерии от действия неблагоприятных факторов окружающей среды. То есть это особая форма сосуществования бактерий разных видов на поверхности зуба (и не только, но мы сегодня говорим о зубах), которая приносит его обитателям ощутимую выгоду для выживания и добывания питательных веществ.
Схематическое формирование биофильма выглядит так. Отдельные клетки бактерий прикрепляются к поверхности и начинают вырабатывать липкую "слизь" - экзополисахариды (ЭПС) и гликопротеины, которые помогают бактериям хорошо закрепиться и привлечь других бактерий, которые не могут сами инициировать приклепление. Дружной кучей они начинают быстро размножаться и увеличиваться в размерах образуя структуру, которая по форме напоминает гриб на ножке. В какой-то момент наступает стабилизация, и отдельные бактерии покидают построенный "домик", чтобы найти себе другую поверхность для жизни. Как правило, это происходит в случае, когда не хватает питательных веществ. **На самом деле все гораздо сложнее, и я бью себя по рукам, чтобы не углубиться в молекулярные механизмы, quorum sensing, борьбу за ресурсы, комменсализм и прочие детали, для понимания которых придется написать целый трактат**.

А это налет на зубах (биофильм) в схематичном изображении. Выглядит как поляна с грибами, состоящая из огромного разнообразия бактерий.

Формирование зубного налета происходит в определенной последовательности и включает в себя несколько стадий.
1) После чистки зубов уже через 2-4 часа поверхность зуба заселяют "ранние колонизаторы". Это непатогенные Грам (+) кокки. Затем к ним присоединятся разные палочки, и все вместе они образут первичную пленку на зубах, которую еще не видно. Бактерии получаются нутриенты из слюны и еды, которая попадает в рот.
2) Следом за ними появляются бактерии-мостики - длинные палочки и филаменты, которые помогают менее "липким" бактериям зацепиться за строящийся биофильм.
3) Если плохо следить за гигиеной рта и зубов, то уже через 4-7 дней биофильм разрастается, утолщается и становится привлекательным местом для жизни патогенных бактерий, что влечет за собой воспаление тканей десен.

А что сахар, чем он вреден? Сахар используется бактериями как источник еды и энергии, а в процессе метаболизма выделяется кислота. Она и становится причиной разрушений эмали и деминерализации зубов. Ткань зуба под эмалью - это тоже отличный источник еды для бактерий, поэтому они начинают разрастаться и продолжать свое пакостливое дело. Чем больше на зубах налета, тем бОльший процент патогенных бактерий способных разрушать зубы, там находится. Так что гигиена полости рта (чистка, флосс, регулярный осмотр у дантиста) и твердая пища, которая естественным образом очищает зубы, наше все!
КАРТИНКИ
- К сожалению, у меня не было реагентов для окраски бактерий по Граму, поэтому я использовала другой универсальный краситель. Он окрашивает полисахариды в фиолетовый цвет, а их достаточно в любой бактерии или клетке. Без красителя бактерии под микроскопом увидеть практически невозможно, поэтому пришлось красить.
- Использовала 3 метода микроскопирования: Bright Field, Phase-contrast, DIC.
- Объектив 100х, увеличение в 1000 раз.
****
Bright Field: хорошо различимы круглые бактерии кокки и палочки разной длины, в том числе огромные филаменты.

Видно, что палочки образуют цепочки из нескольких клеток.


Phase-contrast: для бактерий это не самый информативный метод.

DIC: А тут уже интересно, потому что бактерии приобрели 3D объем.


А тут мне за одно попалась та самая эпителиальная клетка полости рта, про которую я рассказывала в прошлый раз. Краситель отлично выделил ее ядро.
Bright Field

Phase-contast

DIC

*
no subject
Date: 2018-06-27 05:31 pm (UTC)Ой, как интересно! Спасибо! 😊
no subject
Date: 2018-06-27 09:28 pm (UTC)no subject
Date: 2018-06-27 05:33 pm (UTC)no subject
Date: 2018-06-27 09:28 pm (UTC)(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:no subject
Date: 2018-06-27 05:37 pm (UTC)no subject
Date: 2018-06-27 09:29 pm (UTC)(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:no subject
Date: 2018-06-27 05:54 pm (UTC)Не знаю, уместно ли тут будет позанудствовать, но про фазовый контраст ты зря, я всегда делала фазовый + флуоресценцию, потому что по фазовому граница клетки выходит контрастнее и легче находится программами (можно делать автоматическую сегментацию).
no subject
Date: 2018-06-27 09:33 pm (UTC)Думаю, что да. Я, когда их увидела, прифигела, что такая огромная штука во рту сидит. Образец взяла днем после утренней чистки зубов. Видимо, я плохо чищу по утрам зубы 8)) Вечером чищу гораздо тщательнее.
Я про фазовый контраст имела в виду в этом конкретном случае. Тем более мой слайд был сделан на коленке и без соблюдения каких-то серьезных протоколов. =) А так то да, в зависимости от того, что хочешь получить, используешь то, что работает лучше.
(no subject)
From:(no subject)
From:no subject
Date: 2018-06-27 06:06 pm (UTC)а вообще налет - мой бич. он у меня образуется очень быстро и выглядит как у курильщика с 30 летним стажем. это просто жесть. чистку приходится делать дважды в год, чаще просто нельзя. плюс щетка ультразвуковая (помогает, но не идеально). после чистки, даже с ультрозвуковой щеткой, налет становится заметным уже через три месяца. и каждый гигиенист считает своим долгом спросит сколько пачек в день я выкуриваю. мечтаю чтобы что-нибудь придумали уже для более эффективной борьбы с этой гадостью. Прикол в том что зубы у меня сами по себе довольно белые, но вот на нижних этот чертов налет постоянно образуется. Эмаль там какая то особая что ли
no subject
Date: 2018-06-28 02:29 pm (UTC)(no subject)
From:(no subject)
From:no subject
Date: 2018-06-27 06:10 pm (UTC)Thsts crazy! There is a whole world in everyones mouth!
no subject
Date: 2018-06-27 09:33 pm (UTC)no subject
Date: 2018-06-27 06:11 pm (UTC)Ане уже презентацию показывала? :)
У меня любит о микробах слушать.
no subject
Date: 2018-06-27 09:34 pm (UTC)no subject
Date: 2018-06-27 06:22 pm (UTC)no subject
Date: 2018-06-27 09:34 pm (UTC)(no subject)
From:no subject
Date: 2018-06-27 06:26 pm (UTC)no subject
Date: 2018-06-27 09:35 pm (UTC)Скоро начну рассказывать про простейших. Закопалась по самые уши.
(no subject)
From:(no subject)
From:no subject
Date: 2018-06-27 06:47 pm (UTC)no subject
Date: 2018-06-27 09:35 pm (UTC)no subject
Date: 2018-06-27 08:49 pm (UTC)no subject
Date: 2018-06-27 09:37 pm (UTC)А вообще главная цель постов - это показать забавные картинки, которые я наделала. А то лежат без дела, жалко же!
(no subject)
From:no subject
Date: 2018-06-27 09:06 pm (UTC)О, а можно вопрос! Моему ребенку просто делали недавно тест на какие-то бактерии в слюне и сказали по итогу, что у него они агрессивные и их много и поэтому у него кариес быстрее, чем у других других детей, развивается. Бактерии правда могут быть агрессивными?
no subject
Date: 2018-06-28 02:25 pm (UTC)(no subject)
From:no subject
Date: 2018-06-28 01:57 am (UTC)Мне последняя картинка нравится. Такое сравнение по размерам эукариота и прокариотов.
no subject
Date: 2018-06-28 02:17 pm (UTC)Не знаю, на сколько меня хватит микроскопировать всякую фигню, поэтому не хочется превращать удовольствие в обязаловку.
no subject
Date: 2018-06-28 02:28 am (UTC)Спасибо, очень интересно!
no subject
Date: 2018-06-28 02:19 pm (UTC)Я тоже задумалась, что нужно тщательнее чистить.
no subject
Date: 2018-06-28 02:53 am (UTC)no subject
Date: 2018-06-28 02:14 pm (UTC)no subject
Date: 2018-06-28 03:33 am (UTC)http://dent.umich.edu/news/2013/06/04/bacterium-causing-periodontal-disease-isolated
no subject
Date: 2018-06-28 02:14 pm (UTC)(no subject)
From:(no subject)
From:no subject
Date: 2018-06-28 05:20 am (UTC)и здорово, что ваш универ проводит такие "догоняющие" мероприятия для студентов! если они до того были увлечены биологией. то как тут в неё совсем не влюбиться! С такими-то возможностями!
no subject
Date: 2018-06-28 02:11 pm (UTC)no subject
Date: 2018-06-28 07:30 am (UTC)Очень круто! Вообще у тебя талант популяризатора.
no subject
Date: 2018-06-28 10:04 am (UTC)(no subject)
From:(no subject)
From:no subject
Date: 2018-06-28 10:01 am (UTC)Страшно интересно :)
no subject
Date: 2018-06-28 02:08 pm (UTC)no subject
Date: 2018-06-28 01:01 pm (UTC)Мне мама вчера сообщила, что у кошек рот стерильный, а у людей как у свиней :)))
no subject
Date: 2018-06-28 02:08 pm (UTC)no subject
Date: 2018-06-28 04:11 pm (UTC)no subject
Date: 2018-07-02 04:06 pm (UTC)no subject
Date: 2018-06-28 09:34 pm (UTC)no subject
Date: 2018-06-29 04:09 am (UTC)no subject
Date: 2018-07-02 04:07 pm (UTC)no subject
Date: 2018-06-29 03:10 pm (UTC)Надо детскую книжку такую придумать с картинками :)
no subject
Date: 2018-07-02 04:09 pm (UTC)no subject
Date: 2018-06-29 05:05 pm (UTC)no subject
Date: 2018-07-02 04:09 pm (UTC)