nervo4ka | Занимательная микроскопия: Реконструкция глаза фруктовой мушки

*
Как-то перед новым годом к нам пришла студентка и сказала: "У вас есть микроскоп Х, я хочу научиться им пользоваться, чтобы делать картинки как в статье", и протянула статью. Она собиралась микроскопировать глаза фруктовой мушки дрозофилы. Ей было важно видеть каждую фасетинку, чтобы делать изменения и сравнивать, как влияют те или иные мутации на строение глаза. Картинки в статье выглядели зашибись. Но я точно знала, что с нашим микроскопом Х это просто невозможно. Ну да, сама модель инструмента действительно та же самая, но оптическая начинка и встроенные функции (add ons) совсем другие. Наш микроскоп уступает ~~приблизительно в тыщу раз~~ и по качеству, и по цене. Мы, конечно же, попробовали, но ничего не вышло. Тогда решили перейти на другой микроскоп, более продвинутый. Уже лучше, но все равно фигня какая-то. Сидишь и думаешь, ну КАК, КАК делают такие удивительные микрофотографии, которые публикуют потом в журналах или отправляют на конкурс? Почему крутой микроскоп есть, а мозгов, как им правильно воспользоваться, нет. Мозги-то есть, практики нет.

Стали пробовать разные варианты настроек, добавили функцию ~~слайсить писами~~ последовательного сканирования (Z-stacking), чтобы сделать 3D реконструкцию, добавили освещения. Все равно получается какая-то фигня и дисбаланс цветов.

Несколько часов спустя получилась вот такая картинка! Правда не у меня, а у начальницы, которая тоже подключилась к процессу. Пришлось довольно сильно менять ряд установок в программном обеспечении, о которых я не знала, сложным образом играть с дополнительным освещением. Но самый важный трюк - это использование специальной платной программы, которую упоминали авторы статьи и которая делает из гомна конфетку. К счастью, получилось воспользоваться ей бесплатно, т.к. при установке дали тестовый месяц.

А это набор фотографий с разным фокусом (z-stacks), из которых потом собиралась финальная фотография, где весь глаз оказался в фокусе. Ведь чисто физически нереально сделать фотографию объемного предмета, чтобы разные плоскости оставались в фокусе. Именно поэтому и используют последовательное сканирование, из которого потом формируется 3D объект. Здесь увеличение в 100 раз.

Глаз на большем увеличение. Если не ошибаюсь, в 400 раз. Та же реконструкция из 14 последовательных фотографий с помощью специальной программы.

Гифка в догонку, чтобы оценить всю красоту. 8))

Студентка осталась очень довольна результатом. Именно такую картинку она и хотела увидеть. Потом мы провели ей тренинг, чтобы она смогла микроскопировать самостоятельно. Зато я осталась ужасно недовольна собой. Без помощи начальницы я не справилась. Как же мало я знаю при том, что вроде бы знаю много! Каждый эксперимент уникален, и все знать совершенно невозможно, особенно с технологиями, которые развиваются семимильными шагами, ~~а я стою на месте~~. Это совершенно нормально - узнавать новое в процессе. Но все равно хочется иногда оттянуться по полной в синдроме самозванца и пострадать на тему "какая же дура была я, но поздно уж было рыдать". *Конец минутки слабости*. ~~Тут можно пожалеть и сказать: "Ну, Лен, ну ты же умная! Правда! Только немножечко дура~~. =))

*